بررسی نشانگر کلروپلاستی trnl-f در تعیین تمایز دو گونه صنوبر: سفیدپلت و سپیدار

هدف این تحقیق بررسی قدرت نشانگر کلروپلاستی trnl-f در تمایز ژنتیکی و ارتباط فیلوژنتیکی سپیدار (populus alba) و سفیدپلت (populus caspica) است. تعداد 15 نمونه برگی از هفت رویشگاه مختلف جنگل های هیرکانی ایران؛ استان های گیلان و مازندران، جمع آوری شدند. dnaی ژنومی از برگ ها با استفاده از روش ترکیبی ctab و sds- پتاسیم استات استخراج گردید. واکنش pcrی با استفاده از پرایمرهای جهانی انجام شد و قطعات trnl-f تکثیر شده توالی یابی گردید. نتایج نشان دادند که طول منطقه trnl-f تقریبا برای جمعیت های هر دو گونه در حدود 392-394 نوکلئوتید است. در مقایسه با توالی های موجود در بانک ژنی، تعداد نوکلئوتیدهای آدنین و تیمین در سفیدپلت و سپیدار بیش تر از دیگر نوکلئوتیدها است. ترکیب نوکلئوتیدی این دو گونه بسیار مشابه با حداقل فاصله ژنتیکی از یکدیگر (= 005/0) می باشد. آنالیز پارسیمونی از 582 جایگاه نوکلئوتیدی؛ 178 جایگاه محافظت شده، 197 جایگاه متغیر، 151 جایگاه پارسیمون و 46 جایگاه انحصاری را نشان داد. رسم درخت فیلوژنی براساس نشانگرtrnl-f نیز نشان داد که توالی این نشانگر نمی تواند تمایز بین پایه های دو گونه سپیدار و سفیدپلت ایجاد کند چراکه نمونه های بررسی شده در یک گروه مشترک قرار گرفتند. از نتایج این تحقیق می توان استنتاج نمود که نشانگر کلروپلاستی trnl-f نتوانست دو گونه سپیدار و سفیدپلت را از یکدیگر متمایز نماید. بنابراین برای شناخت دقیق این گونه ها، بازسازی فیلوژنی با استفاده از سایر نشانگرهای کلروپلاستی و یا هسته ای پیشنهاد می گردد.